在新的形势下，对实验室完善治理结构，更加规范和高效地管理整个实验室的运转。拟定的大鲵工程实验室治理机构由大鲵工程实验室管理委员会和学术委员会构成，由管理委员会和学术委员会推选产生实验室主任，全权负责实验室工作。实验室辖科研业务管理办公室、产学研管理办公室及综合办公室3个职能部门，其中科研业务管理办公室辖大鲵基础生物学与资源保护研究、大鲵苗种繁殖与养殖标准化技术研发与大鲵产品综合利用关键技术研发3个平台。产学研管理办公室辖成果转化、技术培训与社会服务3个中心。综合办公室主要负责行政事务、外联事务和其他事务（具体组织结构图见图1）。

图1. 大鲵工程实验室组织结构图

1）大鲵工程实验室管理委员会工作职责：根据大鲵工程实验室管理委员会决议，主持大鲵工程实验室全面工作；贯彻发展战略、把握发展方向、实施经营计划、审定采购方案、决策人事安排、提出年度预决算等。

2）学术委员会工作职责：组织大鲵工程实验室的学术交流活动，根据国内相关该产业发展现状、趋势与问题，把握大鲵工程实验室的研究方向，决定大鲵工程实验室重大研究项目的选择，对大鲵工程实验室的发展进行咨询与指导。

3）科研业务管理办公室工作职责：负责项目申报、起草年度研究计划、起草工程实验室中长远研究规划；协调、管理工程实验室各业务平台的科研业务工作，组织对外有偿服务，承接相关工程研究、设计业务；开展国内外交流与合作等，其辖3个研究平台构成大鲵工程实验室的特色、关键技术与核心组成。

① 大鲵基础生物学与资源保护研究平台：是大鲵工程实验室的特色组成部分。通过提高大鲵的人工放流技术水平与生境恢复技术，研究大鲵自然种群恢复关键技术；通过建立自然种群监测站、大鲵种质资源库实施并健全大鲵资源保护技术。

② 大鲵苗种繁殖与养殖标准化技术研发平台：是大鲵工程实验室的关键技术组成部分。主要负责完善地理标志产品“张家界大鲵”的苗种规范化生产标准与养殖规范化生产标准，通过建设繁殖与养殖标准化生产基地，为大鲵规模化苗种繁殖与大鲵养殖提供标准化生产技术。

③ 大鲵产品综合利用关键技术研发平台：是工程实验室的核心组成部分与相关成果产业化转化成败的关键终端环节。主要负责研究大鲵功能成分的提取分离技术，功能成分的作用机理，大鲵综合利用新产品开发、生产技术与产品质量标准，为大鲵的综合加工利用提供技术基础，包括为大鲵食品、功能性食品及其美容产品等加工生产提供标准化、现代化高新技术，为大鲵各种系列终端产品生产提供工艺技术系统集成的一体化生产技术等。

4）产学研管理办公室工作职责：负责与产学研合作相关企业之间的联系，提出产学研合作年度计划，向大鲵工程实验室及时发布企业产学研需求信息及其它产学研相关信息，同时负责向企业及时宣传大鲵工程实验室，向企业适时发布大鲵工程实验室的产学研合作意向及其它相关的信息工作，负责组织产学研相关的接待工作及培训工作，其辖成果转化中心、技术培训中心与社会服务中心是大鲵工程实验室实现效应化、社会化的重要组成。

① 成果转化中心：是大鲵工程实验室实现效益化的实施部门，负责收集整理大鲵工程实验室与合作单位的最新研究成果，将其在合作企业进行转化，促使研究成果效益化。

② 技术培训中心：是大鲵工程实验室实的信息收集与技术培训部门，负责收集国内外本领域信息情报和市场信息，为大鲵工程实验室研究方向提供决策依据；开展对外有偿服务，针对行业技术人员进行培训；完成政府下达的扶贫任务。

③ 社会服务中心：是大鲵工程实验室实的对外窗口，负责对外宣传大鲵工程实验室实的成就，接待人员来访，协助企业产品策划，签订项目合作协议，指导鲵农生产经营等，实现大鲵工程实验室实与社会的无缝对接。

5）综合办公室工作职责：负责行政事务，协调各方关系，提出人事安排建议，进行基建监管，管理党务及工青妇工作，搞好外事接待等。